Профессор Чарльз Ксавьер был лидером Людей Икс, группы мутантов, которые пытались найти мир с человеческой расой, обучить молодых мутантов ответственному использованию своих способностей и остановить Магнето от начала войны с человечеством. Команда базируется в Школе Ксавьера для одаренных детей , управляемой из особняка Ксавьера в Вестчестере. База включала подземные медицинские лаборатории, учебный центр под названием « Комната опасности », ангар для самолетов и Церебро .
До формирования Людей Икс, профессор Чарльз Ксавьер и его соратник, Рейвен Даркхольм, были связаны агентами ЦРУ, чтобы помочь расследовать Клуб Адского Пламени , тайную организацию мутантов с подозреваемыми преступными операциями. Связь с ЦРУ вскоре привела Ксавьера к другим мутантам, включая Эрика Леншерра, Хавока , Дарвина , Зверя и Банши .
Группа мутантов Ксавьера затем вступила в конфликт с Клубом Адского Пламени, что привело к убийству Дарвина от руки лидера Клуба Адского Пламени. Ксавьер решил остановить Клуб Адского Пламени и начал тренировать свою молодую группу, готовясь к грядущим конфликтам. Во время последующих столкновений с Клубом Адского Пламени взгляды Эрика и Чарльза относительно пути зарождающейся расы мутантов разошлись, что привело к концу их дружбы и расколу их зарождающейся команды. Эрик, теперь носящий имя «Магнето», ушел, чтобы сформировать Братство Мутантов , а Даркхольм последовал за ним, в то время как Ксавьер продолжил формировать остальных в команду с более высокой целью: Людей Икс.
Вскоре после открытия Школы Ксавьера для одаренных детей начинается и усиливается война во Вьетнаме, из-за чего многие ученики и преподаватели школы покидают ее. В конце концов Ксавьер закрывает школу, и он и Хэнк изолируются в особняке.
Уильям Страйкер отправил своего сына Джейсона в школу Ксавьера в надежде избавить его от мутации, считая это болезнью, которую, по его мнению, нужно вылечить. У Ксавьера не было никакого интереса или веры в «лечение» мутантов, что разозлило Страйкера. Позже Ксавьер помог освободить детей-мутантов, которых Страйкер держал в плену на Три-Майл-Айленде. Он забрал их и улетел на своем вертолете со Скоттом Саммерсом и Эммой Сильверфокс . Саммерс впоследствии возглавил Людей Икс.
Найдя Джин Грей , Ксавьер начал контролировать ее с помощью телепатических блоков, поскольку считал, что ее способности класса 5 были слишком сильны для нее. Ее сдерживаемые способности проявились в виде альтернативной личности, похожей на ид, называемой «Феникс» — чисто инстинктивного существа, которым управляют только его собственные жестокие желания.
В какой-то момент он завербовал Ороро Монро, которая также стала Человеком Икс.
В Канаде Циклоп и Шторм спасли Росомаху и молодого беглеца Роуга от Саблезубого Братства и привели их в Особняк Икс. Ксавьер предложил помочь Росомахе узнать секреты его забытого прошлого.
Мистик проникла в школу и саботировала Церебро. Когда Ксавьер использовал Церебро, он впал в кому. Несмотря на его отсутствие, Росомаха и Люди Икс помешали Магнето мутировать лидеров на Всемирном саммите на острове Свободы. Магнето намеревался использовать способность Роуга поглощать способности других мутантов на себе, чтобы Роуг мог питать свою машину. Приложив руку к ее лицу, Росомаха сумел передать свои регенеративные способности умирающей Роуг, спасая ее. Профессор Ксавьер вышел из комы, а Магнето был взят под стражу.
Позже Ксавьер навестил Магнето в его пластиковой тюремной камере, и они сыграли в шахматы. Магнето предупредил своего друга, что продолжит свою борьбу, на что Ксавьер пообещал, что он и Люди Икс всегда будут рядом, чтобы остановить его.
Уильям Страйкер начал экспериментировать на мутантах, используя препарат, вводимый прямо в затылок, чтобы контролировать их. Он использовал Ночного Змея , телепортирующегося мутанта, чтобы организовать атаку на президента в Белом доме, но Ночной Змей потерпел неудачу и сбежал. Шторм и Джин выследили Ночного Змея.
Циклоп и Профессор Икс были захвачены Страйкером и его помощницей Юрико Оямой . Страйкер приказал своим войскам совершить набег на X-Mansion, где солдаты усыпили каждого студента, которого они смогли найти. Некоторых отвезли на базу Страйкера, расположенную в озере Алкали , внутри плотины, в то время как другие сбежали. Росомаха вместе с Роугом, Айсменом и Пиро сбежали в дом Айсмена в Бостоне . После звонка 9-1-1 от брата Бобби Ронни прибыла полиция, которая возглавила спор с Пиро. Джин и Шторм прибыли на Икс-Джете, чтобы забрать их всех. Люди Икс объединились с Магнето и Мистик, чтобы остановить Страйкера.
Страйкер украл достаточно оборудования из собственного подразделения Ксавьера Cerebro, чтобы построить второй Cerebro, с помощью которого он планировал убить всех мутантов в мире. Страйкер получил контроль над профессором Ксавьером через своего сына, Джейсона Страйкера, который был способен проецировать мощные видения в разум, ослепляя человека к реальности. Профессору X было поручено использовать Cerebro, чтобы найти и убить всех существующих мутантов. Мистик, замаскированная под Страйкера, использовала Джейсона, чтобы убедить Профессора X убить всех людей. Ночной Змей телепортировал Шторм внутрь Cerebro, где она освободила Профессора от его телепатической иллюзии.
Джин, Магнето и Мистик подверглись нападению Циклопа с промытыми мозгами по пути на спасение Профессора Икс, что привело к повреждению генераторов, удерживавших плотину от обрушения. Сила телекинетического взрыва Джин пробудила Циклопа от промывания мозгов. Росомаха нашел Страйкера в плавильной комнате адамантия вместе с Леди Смертельный Удар. Росомаха и Смертельный Удар сражались. Росомаха был вынужден убить ее. Магнето и Мистик использовали вертолет Страйкера, чтобы сбежать из Щелочного озера, приковав Страйкера к бетонным обломкам. Росомаха нашел Страйкера на посадочной площадке, где Страйкер попытался выторговать себе жизнь, Росомаха. Росомаха оставил его умирать.
Неисправность на борту X-Jet помешала ему взлететь, и плотина в конце концов прорвалась. Потоп усилился, затопив Страйкера. Джин покинула самолет и создала телекинетическую стену, чтобы остановить волну, и в то же время подняла самолет над потоком воды, все это время окруженная огненной короной. Джин активировала основные двигатели X-Jet, прежде чем выпустить поток воды на себя.
Люди Икс смогли предоставить президенту файлы из личных кабинетов Страйкера. Профессор Икс предупредил его, что людям и мутантам придется работать вместе, чтобы построить мир, иначе они уничтожат друг друга в войне. Шельма и Айсмен были повышены до Людей Икс.
Китти Прайд и Питер Распутин были повышены до Людей Икс.
Фармацевтическая компания Worthington Labs объявила, что разработала вакцину для постоянного подавления X-гена, который дает мутантам их способности, предлагая так называемое « лечение » любому мутанту, который этого захочет. Лекарство было получено от мальчика-мутанта по имени Джимми . Хотя некоторые мутанты были заинтересованы в лекарстве, включая Роуга, многие другие были в ужасе от этого объявления.
В ответ на эту новость Магнето решил собрать армию, предупредив своих последователей, что лекарство будет использовано для уничтожения расы мутантов. Магнето устроил засаду на военный транспорт и освободил Джаггернаута , Мистик и Множественного Человека , во время чего Мистик заблокировала выстрел лекарства от мутантов, направленный на Магнето, только чтобы остаться позади, потому что она больше не была «одной из них».
Циклоп, все еще убитый горем из-за потери Джин Грей, вернулся в Алкали-Лейк. Джин явилась Циклопу, и когда они поцеловались, Джин изменилась и убила Циклопа. Почувствовав неприятности, профессор Чарльз Ксавьер послал Росомаху и Шторм расследовать это дело. Когда они прибыли, двое Людей Икс столкнулись с бессознательной Джин. Большая часть силы Джин находилась в ее бессознательном разуме, и ее силы в значительной степени подпитывались инстинктами, а не находились под ее полным контролем.
Джин умоляла Росомаху убить ее, прежде чем она сможет причинить вред кому-либо еще, но когда он отказался, Феникс появился и сбежал в дом ее детства. Магнето, также осознавая, что силы Джин были освобождены, встретил Ксавье в доме Джин. Двое мужчин умоляли о верности Джин, пока Феникс не появился снова, высвободив свою разрушительную силу. Разъяренная тем, что ее двадцать лет держали в клетке подсознания Джин, она разрушила дом своей семьи и вступила в психическую битву с Ксавье. В конце концов она одолела и расщепила Ксавье, а затем ушла с Магнето, временно ослабленным.
Люди Икс перегруппировались и столкнулись с армией Магнето, которая атаковала лабораторию фармацевтической компании на острове Алькатрас , которую охраняла только рота солдат. Во время битвы Китти Прайд спасла Джимми, Айсмен сразился один на один с Пиро, а Зверь ввел Магнето лекарство, аннулировав его силы мутанта. Росомаха почти вернул Джин к здравомыслию. Однако после того, как солдаты открыли огонь по Джин, Феникс быстро появился и начал уничтожать все и всех вокруг нее. Росомаха пробился к Джин, полагаясь на свои целительные способности, чтобы спасти его от ее разрушительной силы. На мгновение обретя контроль, Джин умоляла Росомаху спасти ее. Сказав Джин, что любит ее, Росомаха неохотно убил ее своими когтями.
Несмотря на потери Людей Икс, жизнь продолжалась. Школа продолжалась, даже без Ксавьера. Огорченная своей неспособностью физически сблизиться со своим парнем, Роуг решила принять лекарство от мутантов. Магнето, теперь обычный человек, сидел за шахматной доской и протянул руку к металлической шахматной фигуре, которая слегка дрожала — указывая на то, что лекарство может быть не таким постоянным, как изначально предполагалось.
Доктор Мойра МакТаггерт проверила коматозного пациента, который приветствовал ее голосом Ксавьера. Ксавьер перенес свой разум в это новое тело .
Вскоре после событий на острове Алькатрас Люди Икс распались из-за своей малочисленности (хотя школа оставалась активной). Однако Магнето и восстановленный Профессор Икс вскоре поняли, что команде необходимо собраться заново из-за проблемы с последствиями для всех мутантов. Вместе они собрали многих своих учеников, хотя было показано, что был набран только Росомаха.
Бывший член Людей Икс Китти Прайд, Айсмен и Колосс объединились с Санспотом , Бишопом , Блинком и Варпатом , чтобы помочь выжить против Стражей. План состоял в том, что, поскольку Варпат может обнаружить Стражей, он предупредит их, чтобы они могли подготовиться и сразиться со Стражами, в то время как Китти отправит разум Бишопа на несколько дней назад, чтобы предупредить их о предстоящей атаке. Блинк разведывает следующее место, и они исчезают прежде, чем Стражи узнают, что они там.
Они встречаются с Ксавьером и оставшимися Людьми Икс в китайском монастыре. Пока Китти отправляет разум Росомахи назад во времени, остальные готовятся к битве. Спустя неизвестное количество времени Warpath обнаруживает 12 кораблей Sentinel, направляющихся в их сторону. Шторм создает Шторм, который уничтожает несколько кораблей, но большинство из них остаются и начинают выпускать сотни Sentinel. Затем она посылает молнию в Бишопа, чтобы питать его энергией. Блинк открывает портал к Sentinel, и Бишоп стреляет в него. Магнето поднимает X-jet в воздух и отправляет его в полет к Sentinel. Шторм посылает молнию в его топливный элемент, который взрывается, уничтожая тысячи Sentinel. Обломки попадают в монастырь, но Магнето удается остановить большую их часть, но его пронзает осколок.
Люди Икс поворачиваются, чтобы посмотреть на Магнето, когда Страж подпрыгивает и наносит удар Шторм в спину, сбрасывая ее со скалы. Затем Бишоп стреляет в Стража. Команда поднимает глаза и видит, как десятки Стражей спускаются с горы к ним. Три Стража окружают Бишопа и стреляют в него. Он поглощает взрыв до такой степени, что взрывается. Санспот поджигает себя и взлетает, поджигая Стражей. Магнето использует обломки X-Jet, чтобы еще больше запечатать хранилище. Затем Блинк телепортирует его внутрь, где он заключает мир с Ксавье и умирает. Блинк открывает портал, и Колосс прыгает через него, отправляя его в небо. Набрав достаточно импульса, Блинк отправляет его в полет в Стража.
Люди Икс делают последний бой, чтобы выиграть как можно больше времени. Колосс наносит удар кулаком в Стража, который перепрыгивает через него и хватает его за руки, в то время как другой хватает его за ноги, и они тянут его, пока он не разорвется пополам. Варпатч прыгает на стреляющего Стража, только чтобы быть втянутым в его взрыв. Сентинел превращается в алмазную форму, а другой в каменную форму, чтобы бороться с огнем Санспота и окружить его. Один отрезает ему руку, а затем пинает его другому Сентинелу, который наносит ему удар. Сентинел стреляет в Блинк, но она перенаправляет взрыв на других Сентинелей, но в конечном итоге его настигают и закалывают насмерть.
Стражи пробираются в хранилище. Айсмен пытается заморозить его, но безуспешно. Стражи стреляют в него, мучительно убивая его. Они поворачиваются, чтобы казнить Китти и Ксавьера, но затем временная линия меняется навсегда, когда Мистик бросает пистолет и щадит Траска.